计算机辅助工程申请难度：极强的数学背景——应用数学，数学建模，计算工程，同时还需要计算机语言能力和计算机软件运用能力。如果能在具有这些能力的同时还能有相应的其他背景(如申计算流体力学有流体力学背景，申计算机辅助设计有设计经历，计算工程及信息技术有EE背景)那么会使自己在申请中得到很大程度上的加分。
由于偏向CS和EE，美国申请者，国际学生都很喜欢这个专业，所以申请的难度大大增加。虽然不如EE和CS，但是由于众多EE和CS 的申请者为了躲避本专业的高难度申请，纷纷转向同本专业结合非常紧密而且有不错就业前景的这个方向，造成了此方向的同前面三个方向相比难度大了非常多。
系统与自动控制申请难度：需要数学、计算机语言编程、基本的EE相关背景(电子电路知识)、控制的鲁棒与最优控制、鲁棒多变量控制系统、大规模动态系统、多变量系统的标识、最小最大控制与动态游戏、用于控制 与信号处理的自适应系统、随机系统、线性与非线性评估的设计、随机与 自适应控制等等，同时根据不同侧重点，应有相应的设计制造、动力学、仪表等相关背景。
同计算机辅助系统相比，此方向的研究内容更加靠近EE这个理工科中最难申请的专业。而且国内的ME和EE专业无一不会设置自动控制上的课程，所以说这个方向是ME的中国学生也是美国和国际学生申请方向最集中的专业方向，加上EE和CS的申请人群的转移，所以这是ME专业中最难申请的方向。
微电子系统申请难度：MEMS是一个极端多学科交叉的领域，最基础的方面是微制备技术的加工知识，制造微小结构的方法，同纳米技术结合紧密，所以很强的纳米技术必不可少。同时根据不同侧重点还需要有基本的机械理论知识，流体，力学相关知识。
这也是一个新兴的交叉学科，对美国学生有很大吸引力，另外由于EE学科中也有这个方向的设置，所以申请难度仅次于系统与自动控制。有强纳米材料背景的申请者会在申请中占有优势。
